La Franche-Comté compte 130 fruitières, entreprises coopératives qui transforment le lait de producteurs en 4 fromages AOP : Comté, Morbier, Mont d’Or et Bleu de Gex.
Historiquement, ces fruitières des deux départements du Doubs et du Jura se sont fédérées au sein de la FRCL du Massif Jurassien pour défendre leurs intérêts et les accompagner au mieux dans leur fonctionnement.
La FRCL du Massif Jurassien, au vu du poids de la transformation fromagère AOP en Franche-Comté est un acteur majeur de la filière fromagère.